Dopo il massacro avvenuto nel distretto 11 sei mesi fa, molte cose sono cambiate. Kotaro Amon viene promosso e gli viene assegnata una nuova partner. Anche Juzo viene promosso e finalmente ottiene la sua tanto desiderata arma. Ne avrà bisogno per dare la caccia ai ghoul di classe SS, liberati durante l'attacco alla prigione dei ghoul. A questo proposito, gli investigatori del CCG sono ancora completamente all'oscuro. Ma improvvisamente, ricevono aiuto da un informatore sconosciuto di nome Hideyoshi.